Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ccdc88cQ6VGS5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc88cQ6VGS5 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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