Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smchd1Q6P5D8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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