Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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