Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ric1Q69ZJ7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ric1Q69ZJ7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ric1Q69ZJ7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms