Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Neurod1Q60867 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms