Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CttnQ60598 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CttnQ60598 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms