Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sft2d1Q5SSN7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms