Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc27Q3V036 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms