Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Skap2Q3UND0 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Skap2Q3UND0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms