Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CrxosQ3UL53 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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