Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sf3b2Q3UJB0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms