Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc34Q3UI66 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms