Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Q3U595 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Q3U595 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q3U595 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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