Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Hectd3Q3U487 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms