Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Kdm4dQ3U2K5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms