Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rnf149Q3U2C5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms