Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hace1Q3U0D9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms