Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fndc4Q3TR08 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms