Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ptchd1Q14B62 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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ptchd1Q14B62 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms