Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

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Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ccdc162pQ0VG85 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ccdc162pQ0VG85 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc162pQ0VG85 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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