Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rundc1Q0VDN7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rundc1Q0VDN7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms