Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab42Q0PD08 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms