Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ubxn2bQ0KL01 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ubxn2bQ0KL01 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ubxn2bQ0KL01 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms