Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
F13bQ07968 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms