Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sh3bp2Q06649 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sh3bp2Q06649 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms