Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fgfr4Q03142 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fgfr4Q03142 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms