Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EgfrQ01279 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms