Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Grin2bQ01097 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms