Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chl1P70232 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chl1P70232 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms