Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SbdsP70122 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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