Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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UbdP63072 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
UbdP63072 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms