Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pou3f4P62515 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms