Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Lmo4P61969 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Lmo4P61969 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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