Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P58686 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
P58686 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
P58686 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P58686 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms