Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gabrr1P56475 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gabrr1P56475 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms