Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtgfrP43117 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtgfrP43117 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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