Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lig1P37913 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms