Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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