Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcaP20444 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms