Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Gata1P17679 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms