Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cd5P13379 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms