Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RaraP11416 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RaraP11416 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RaraP11416 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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