Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Hoxd4P10628 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms