Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Itgb1P09055 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Itgb1P09055 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms