Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P04212 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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P04212 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P04212 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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