Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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H2-Ab1P01921 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
H2-Ab1P01921 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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