Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Stra6O70491 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms