Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Foxq1O70220 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms