Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
FxnO35943 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FxnO35943 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FxnO35943 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
FxnO35943 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
FxnO35943 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
FxnO35943 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
FxnO35943 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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