Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms